巧克力囊肿的主要症状就是月经期间腹痛会比较严重，多数女性都会在月经期腹痛会加重，卵巢巧克力囊肿，又称为卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的病变导致的。
月经前两天会有疼痛。月经期间疼痛最明显，月经后可慢慢缓解。巧克力囊肿妇女可能有盆腔粘连，可能表现为慢性盆腔疼痛或性疼痛。大多数妇女去看医生是因为她们不孕。一些女性巧克力囊肿大而破裂，可能表现为突发性下腹痛无法缓解，并伴有恶心、呕吐等症状。
当女性患有巧克力囊肿时，需要根据病人的年龄生育要求，是否有明显的临床症状，选择个床症状。
巧克力囊肿的治疗主要分为药物保守治疗和手术治疗。如果囊肿相对较小，保守治疗可通过口服避孕药、孕酮，如米非司酮、孕三烯酮或促性腺激素释放激素激动剂，如亮丙瑞林、戈舍瑞林等。如果患者药物治疗效果差，症状无法缓解，局部病变加重，或生育功能未恢复，或卵巢囊肿大于4cm，建议选择手术治疗。腹腔镜手术是巧克力囊肿的首选。
如果我们自己患有巧克力囊肿，一定要注意控制自己的性生活时间和次数，避免生殖系统遭到细菌感染，我们的饮食上多吃些高蛋白、高脂肪、低钠、低盐食物，还要避免过度劳累，尽量不要熬夜，此外，术后要服用三到六个月的亮丙瑞林，以防止疾病的复发。
